Nuevo chip de genotipado de Eurogenomics
Se trata de un chip que permitirá caracterizar millones de reproductores clave en Europa.
Desde el pasado mes de abril, el consorcio EuroGenomics ha comenzado a utilizar el chip EuroGMD, una versión mejorada del EuroG10K, que estaba en uso desde 2013.
Desde esa fecha, se ha utilizado un chip diseñado por un consorcio de investigación europeo para caracterizar millones de reproductores clave en toda Europa. En la actualidad se estaba empleando la versión 8 del chip.
Nuevo EuroG MD
Ahora, los científicos que colaboran con EuroGenomics han desarrollado un nuevo chip de genotipado: el EuroG MD. Cuatro veces más grande que la versión más reciente del chip EuroG10K, contiene aproximadamente 45.000 marcadores e incluye los marcadores que inicialmente estaban en el EuroG10K (marcadores utilizados en la verificación de parentesco, variantes genéticas y rasgos que se han añadido en los últimos años).
Como punto de diferenciación respecto a versiones anteriores, el EuroG MD no solo incluye marcadores del chip bovino ILLUMINA LD, sino que incopora aquellos del chip ILLUMINA Bovine SNP50 v3.0 utilizados en las evaluaciones genómicas nacionales en diferentes razas en cada país.
El uso de esta herramienta genómica acelera el progreso genético, logra que el manejo de la diversidad genética sea más sostenible y facilita el manejo de los rasgos genéticos específicos.
Iniciativa científica conjunta
El desarrollo de este nuevo chip es una iniciativa científica conjunta de centros de investigación y empresas de la industria de genética bovina: la Universidad de Lieja (GIGA) y CRV (Países Bajos y Flandes-Bélgica); la Universidad de Aarhus y Viking Genetics (Dinamarca, Suecia y Finlandia); INRA, ALLICE, IDELE y Evolution (Francia); CONAFE, en representación propia, y de Aberekin, Ascol, Fefricale y Xenética Fontao (España), el Instituto Nacional de Investigación (Polaco) de Producción Animal, MCB Krasne y la Federación Polaca de Ganaderos y Ganaderos Lecheros (Polonia) y Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung - VIT y BRS ( Alemania) coordinada por VALOGENE.
El chip EuroG MD es fabricado por ILLUMINA con la tecnología Infinium XT (96 muestras de ADN por chip) o HTS (24 muestras por chip).
